Il Supplementum 2 dell’Enchiridion Vaticanum presenta gli indici generali relativi ai documenti raccolti nei volumi 1-10 (anni 1962-1987). Gli indici sono cinque: strutturale, cronologico, per incipit, di emanazione, analitico. Essi costituiscono uno strumento che facilita l'uso e la consultazione dei volumi, consentendo di reperire i documenti anche senza conoscerne precisamente la data di emanazione e quindi il rispettivo tomo.